食品与制药工程学院成立于2017年7月，下设制药工程、食品科学与工程、食品质量与安全、食品营养与健康四个专业。食品科学与工程、制药工程专业通过IEET国际工程教育认证。制药工程专业为省级一流本科专业建设点，食品科学与工程为校级重点学科。生物与医药硕士专业学位点（与生命科学院联合申报）已通过国务院学位委员会审核，2025年9月将有首届研究生。学院现有实验室面积5500平方米，建有农业农村部农产品质量安全风险评估实验室、广东省食品农产品安全分析与检测工程技术研究中心、广东省食品营养与安全重点实验室、广东省食品与药品实验教学是否中心、肇庆市食品营养与健康重点实验室、肇庆市预制菜营养与健康工程技术研究中心等6个重点教学科研平台。拥有广东省高校制药工程专业教学团队和广东省高校食品检验新技术创新团队等省级教学科研团队。

学院现有教职工68人，博士41人，硕士26人；其中，教授6人、副教授等副高职称20人，中级25人；超过50%的教师具有双师经历，30%的教师具有海外留学背景。现有广东省高校“千百十工程”省级培养对象1人、南粤优秀教师1人、校级培养对象5人，肇庆市高层次人才15人，校学术带头人3人。近年来，学院教师主持国家自然基金5项，获省部级、市厅级等课题80多项，科研经费近1000万元，发表高质量学术论文200余篇，其中SCI收录100余篇。授权发明专利30件、PCT专利2件。

学院秉承“厚德、明智、博学、力行”的校训，始终将提高教育教学质量和培养学生创新能力作为首要任务，注重抓院风建设，坚持“教学为主，科研反辅教学”，团结奋进，求真务实，开拓创新，全面落实应用型人才培养目标，为建设特色鲜明的高水平应用型大学和学校的转型发展不断做出新的贡献。